接下来的工作，大家按照佩良的部署开始忙碌起来。马宇哲、尚君和RIO准备开始实验生物的死亡实验，由阿志进行技术支持。麦子奇则继续进行矩阵的搭建，矩阵已经接近完成，他和他的团队正在做最后的调试，大家很久都没有看到他了。而Maggie，听说家里出了点事情，向团队请了假，急匆匆的和托马斯一起赶回M国，后者则是回去享受圣诞假期以及处理其他项目。
每个人都围绕着以上的理论体系开展着实验。生物死亡实验从普通人的视角看来，是及其残酷的。尤其是RIO和尚君，每次实验生物被执行死亡的时候，他们都选择不在场。尽管佩良批评了他们多次。每次都是由蚁穴的其他工作人员来完成，马宇哲则全程记录。
尽管时间已经过了2036年的新年，春节也将接踵而至。但进行了半个月的实验，让元神项目所有人都遭受了沉重的打击，甚至都出现了极度悲伤和抵触的情绪。
首先死亡的是，002号和003号。一个是患有先天性心脏病，一个是后天被注射毒素，造成肝中毒。代表着疾病死亡。其次死亡的是004号和006号，一个是意外死亡，一个是极度老年后死亡。残酷的是，由于没有时间等待它们的死亡，都被迫用上了科技手段促使它们死亡。
在这群伟大的实验动物被宣布脑死亡后，元神团队用尽技术手段，除了扫描出部分的“衍意识”之外，一个都没有载体中激活或运行。
“不能让它们再牺牲了！”尚君向佩良请示，请求“死亡实验”暂停。后者答应了她，宣布召开一下分析会议。
马宇哲从电脑上调出了实验数据，分析出以下几点：
1、脑死亡后高级神经元是没有反应的，仅有次级神经元还可以保留一部分神经反射的。但这都微不足道。
2、参与死亡的实验动物中，除了004号是意外死亡之外，002号、003号和006号，都是病死或者老死，脑死亡之前，脑电波已经属于微弱状态，死亡之后，脑电波衰减得非常厉害。目前我们的技术还来不及进行信号捕捉，脑电波就全部消失。而004号的脑电波，虽然显示出强劲状态，但脑死亡后，也在短时间内迅速衰减消失。
3、数据分析出，盔甲扫描出的脑电波，仅仅是残存信息，几乎没有“我活着”意识，而“衍意识”数据也是残缺不全，没有达到5维的角度。
“如果将001号和007号，这两个健康的本体进入实验呢？”阿志问到。
佩良看了数据后，叹了口气，说到：“意义不大，它们和004号的生理状态是一样的。”RIO听了之后，舒了口气，还好，博士没有听从建议，尤其是007号，还是一支未成年的黑猩猩幼仔。
“004号，004号的载体还在么？”尚君问到。
阿志调出了数据，说：“还在，你们看，依旧活着。现在我认为，不用删除了吧，既然004号本体已经死亡。”电脑映射出004号载体的视频，它依然在“房间”健康的活着，时不时的玩着小球。“明天，它就可以出去放风了。老麦他们给它渲染出一个院落。”阿志又调出了一个画面，一个近300平米的空间，里面有着大树和灌木，完全是按照黑猩猩的栖息地来的。
“博士，我们按照你的指示，这个房间和院落，是和所有外网严格分开的。只是一个单独的服务器。”阿志又给佩良解释到，后者只是微微点点头。阿志没有注意到，博士他们并没有在意技术上的细节，而是一直看着004号载体。
尚君想了想，说到：“看来还是得从本体死亡之前，移植出意识。这段意识才是完整的，有序的。”
“可这又违背了伦理悖论。而且我们还没有找到封存的办法，或者没有找到这个。”RIO回应到，他正剥开一个橘子，然后挑出一枚种子。
是啊，种子是可以在没有外力条件下，可以封存的。但什么才是意识的种子呢？
马宇哲拿着香烟一直闻着，灵光一现，说到：“可以设想一下，在本体死亡之前，移植出‘我活着’意识和‘衍意识’，这个意识是主观的，没有外界的任何刺激，是无法激活和演进，这就达到了封存的目的。然后本体死亡之后，因为次神经元还残留这一些神经反应，也就是这些微弱的脑电波，我们将这些刺激条件也移植出来，和‘我活着’意识、‘衍意识’一起结合。那不是可以将其激活和演进吗？”
大家都觉得这个办法可以尝试，但又有一个问题摆在面前，从死亡实验数据上来看，残存的脑电波简直是太微弱了，这点反应应该是无法激活种子的。用通俗的话讲，就是种子埋进土里，阳光、水和肥料都不足，根本长不出来。
RIO又趴在桌子上，无聊的玩着打火机，因为不能吸烟，所以他一遍遍的打火，又吹灭。无聊的动作，玩了几次后，他又把打火机拆开，取出里面的电子打火元件，那是一个压电陶瓷。他手贱的用手去按，另一只手指去感受那种电击，“哎哟！”他一下子就甩开了。
佩良正想批评他这种幼稚可笑的行为，看到压电陶瓷之后，说了一句：“电击！我们可以尝试用电击。”
他又操作电脑调出一份资料：这是某个机构早年发表在《自然》杂志上的，研究结果显示，他们在死猪上进行了大脑电击实验，发现当宣布脑死亡后，进行电击，细胞死亡发生的时间比之前认为的要长得多。
尚君说到：“这也许能帮助我们在死亡的大脑里找到有用的东西，这个有待实验去验证。可还有一个问题我们没有解决。我们走老路的话，从存活的本体中移植意识，怎么能保证他只是可以封存的种子，而不是又像004号载体，自己激活和演进呢？”
马宇哲回答到：“我们以前只是从宏观上看待问题，不妨我们换个思路，从围观角度来看待呢？意识是一种脑电波，那为什么不可以从粒子的角度呢？”
RIO来了精神，他在大学的时候，选修过量子物理，他驳斥到：“wave-particleduality（波粒二象性），最早是证实光波，但后来的证实一切物质都具有波粒二象性。电子也会具有干涉和衍射等波动现象，这被后来的电子衍射试验所证实。可是，马老师，您最早也说，只是一种现象，并不是物质啊。”
“原来的定论想得简单了，博士也不是说过么，意识也有生存和繁衍的本能，这些本能原本是作为物质存在的生物具备的，那意识和物质从本质上不是一致吗？”马宇哲回答到，又继续说到：“我最近又查阅了很多关于心理学和量子物理的资料，总结出以下几点，我想对项目有用。”
1、物质的波粒二象性，通过观测得来。观测就有了意识的参与。意识能辨明波粒二象性，意味着意识本身也存在这东西，才能将它识别出来。
2、意识具有波粒二象性，那么把意识看成波，那就是意识波；看成粒子，就是意识粒子。
3、大脑产生的脑电波，就是意识波的物质化。我们可以通过脑电波来研究意识，甚至能据此解读意识。
4、但由于本体死亡后，脑电波衰减厉害，我们只有把角度换为意识粒子。作为粒子，可以聚合为各种形态，乃至载体在矩阵中的各种反应、身体的塑造。
5、同样，我们也可以把“我活着”意识和“衍意识”，看成粒子状态，我们从本体中只需要找到“全同粒子”，里面包含着本体生前的所有五维。这就是种子。
马宇哲讲完之后，也调出了很多资料，大家都在恶补这些信息。
佩良又开始安排下一步的工作，马宇哲和尚君，从“我活着”意识和“衍意识”的角度，去找到“全同粒子”，这解决找到本体意识的种子，又可以封存。RIO和阿志，研究本体脑死亡后，电击大脑，尽可能的延缓神经元细胞的衰减和死亡，这解决种子能在原有刺激条件下激活和演进。
至此，2036年1月7日，项目的理论基础已经全部构建完成，后世将“自动循环”、“意识的生存和繁衍”、“意识是移植而不是复制”、“意识波粒二象性”认定为元神项目的四大理论。